More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1442 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  100 
 
 		 405 aa  785    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 405 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  89.38 
 
 		 405 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  61.54 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  55.81 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.38 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.82 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.5 
 
 		 398 aa  279  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  43.5 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.69 
 
 		 413 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.25 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.7 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.03 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  36.99 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.1 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.71 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.64 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.16 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  39.47 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.06 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.64 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  36.93 
 
 		 416 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.53 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.97 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.22 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.94 
 
 		 421 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.7 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.08 
 
 		 430 aa  225  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 426 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.77 
 
 		 426 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.5 
 
 		 410 aa  222  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.08 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.55 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.01 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 388 aa  212  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.82 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.1 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.51 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.18 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.78 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.78 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.78 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.69 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.95 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.79 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.79 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.79 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  29.79 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.79 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.79 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.34 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.07 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.16 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.16 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.56 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.59 
 
 		 426 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.82 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.8 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.19 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.21 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.9 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.17 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.39 
 
 		 424 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  33.6 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.3 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.69 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.13 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.69 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.06 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  29.97 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.68 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.95 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.95 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.95 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.13 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.48 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30.4 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.04 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  31.02 
 
 		 397 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.17 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.17 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
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