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for query gene Mpop_3613 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  97.16 
 
 
461 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
388 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  97.16 
 
 
425 aa  740    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  79.64 
 
 
423 aa  614  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  62.08 
 
 
445 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.3 
 
 
430 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.21 
 
 
428 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.17 
 
 
410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.62 
 
 
421 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.09 
 
 
421 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.55 
 
 
421 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.6 
 
 
422 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  42.06 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.56 
 
 
415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.45 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  41.15 
 
 
414 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
426 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.16 
 
 
426 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.51 
 
 
420 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.15 
 
 
418 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.24 
 
 
417 aa  262  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.05 
 
 
430 aa  260  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.92 
 
 
425 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.22 
 
 
422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.22 
 
 
415 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.1 
 
 
411 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  38.58 
 
 
437 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.24 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.73 
 
 
412 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.37 
 
 
414 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.54 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  34.83 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.55 
 
 
413 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  33.16 
 
 
406 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.29 
 
 
405 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.87 
 
 
414 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
397 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.84 
 
 
405 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  38.54 
 
 
405 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.37 
 
 
405 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.37 
 
 
405 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  36.1 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  34.77 
 
 
407 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  30.71 
 
 
394 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.29 
 
 
404 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.93 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
397 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.59 
 
 
398 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.69 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 
414 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.19 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.07 
 
 
412 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.78 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.11 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.11 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.85 
 
 
425 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.75 
 
 
407 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.78 
 
 
398 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 
397 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.04 
 
 
418 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.11 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.47 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.61 
 
 
392 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.61 
 
 
392 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.85 
 
 
419 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.82 
 
 
412 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 
424 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.16 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.93 
 
 
461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.85 
 
 
424 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.92 
 
 
402 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.82 
 
 
412 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.76 
 
 
400 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.67 
 
 
425 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.69 
 
 
437 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  30.17 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.61 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.8 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.55 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 
452 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.52 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.31 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.76 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.76 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.34 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.73 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_4159  MFS permease  32.28 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.76 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.71 
 
 
399 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  39.27 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.28 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.94 
 
 
418 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.93 
 
 
413 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.89 
 
 
426 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.81 
 
 
393 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  29.77 
 
 
401 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 
393 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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