More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10238 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  100 
 
 		 406 aa  805    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.93 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.05 
 
 		 398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.35 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.39 
 
 		 410 aa  298  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.34 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  39.9 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.9 
 
 		 405 aa  270  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.99 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  36.99 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.41 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.78 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.61 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 407 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.94 
 
 		 414 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  34.34 
 
 		 401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  36.31 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.08 
 
 		 428 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.6 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.01 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 401 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.68 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.27 
 
 		 420 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.28 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.02 
 
 		 421 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.37 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.3 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  31.96 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 426 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.16 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.16 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.02 
 
 		 412 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.5 
 
 		 430 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.96 
 
 		 415 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.32 
 
 		 417 aa  172  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  29.33 
 
 		 404 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.49 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.16 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.36 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.16 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.36 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.4 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.96 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.38 
 
 		 412 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.71 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.71 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.23 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.71 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.71 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  27.46 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.86 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.51 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.04 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.9 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.25 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.3 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  27.78 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.3 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  27.78 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.43 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.79 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.79 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.79 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.79 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  27.79 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.79 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.53 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.81 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.07 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.22 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.24 
 
 		 403 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 406 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.93 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.52 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.93 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.65 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.12 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.09 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.69 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.01 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.36 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.57 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.06 
 
 		 420 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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