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for query gene Dfer_1509 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 397 aa  783    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.87 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.71 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.47 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.79 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.47 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.63 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.28 
 
 		 420 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.22 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.82 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31 
 
 		 398 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.82 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.75 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.7 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  30.71 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.07 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.74 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  31.98 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.13 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.6 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  32.76 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 388 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  30.64 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.71 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.98 
 
 		 415 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.11 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.19 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.19 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.94 
 
 		 417 aa  143  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.95 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  29.76 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.59 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  28.46 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.36 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.62 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  28 
 
 		 407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.04 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.53 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.14 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.3 
 
 		 393 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  27.62 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.67 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.21 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.25 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.95 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.37 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.94 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.63 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.32 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.04 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.25 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 		 498 aa  113  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.46 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  29.51 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  27.81 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.78 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  26.55 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.87 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.18 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.81 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.52 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.14 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.67 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.46 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.67 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  27.23 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  28.42 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.33 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.34 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.15 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.71 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  26.77 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30.42 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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