More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3362 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 405 aa  797    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.32 
 
 		 398 aa  342  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.01 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  40.35 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.06 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  43.39 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  40 
 
 		 414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.56 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.14 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.11 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  42.7 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.7 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  37.82 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.79 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.34 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.83 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.61 
 
 		 420 aa  256  7e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.58 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.21 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.78 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  37.25 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 423 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.46 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.01 
 
 		 426 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.37 
 
 		 422 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 437 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.62 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 425 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.27 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.85 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.14 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.73 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.6 
 
 		 415 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.01 
 
 		 414 aa  210  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.73 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.55 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.47 
 
 		 408 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.8 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.43 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.37 
 
 		 411 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.5 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  30.53 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.62 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.33 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  31.06 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.35 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.23 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.23 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  32.27 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  30.54 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.64 
 
 		 405 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.93 
 
 		 405 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.05 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.93 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.06 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.76 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  31.95 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.92 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.88 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.64 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.92 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.79 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.87 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.87 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.92 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.25 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.87 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.33 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.87 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.87 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.3 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.5 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.84 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.57 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.83 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.05 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  28.72 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.72 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.72 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.72 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.72 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.15 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.72 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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