More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2971 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 410 aa  808    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.09 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.39 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 461 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.69 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.75 
 
 		 426 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.59 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  45.23 
 
 		 414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.76 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  43.4 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.42 
 
 		 415 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.53 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.32 
 
 		 418 aa  302  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.2 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.61 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.04 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.98 
 
 		 415 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.03 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.96 
 
 		 430 aa  275  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.58 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.34 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.92 
 
 		 410 aa  266  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.23 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.26 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.05 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.89 
 
 		 414 aa  259  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.58 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  34.31 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.2 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.44 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  38.68 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  32.3 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  38.5 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.5 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.58 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.6 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 397 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.09 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.95 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.53 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.02 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.51 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.93 
 
 		 426 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.65 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.75 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.58 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30.39 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.62 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.62 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30.87 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.87 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.92 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.21 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.68 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.7 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.49 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.68 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.23 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.37 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  26.37 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.23 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.95 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.95 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.95 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.87 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  29.01 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.42 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.05 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.7 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.65 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.41 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.65 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.49 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  29.23 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.42 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.4 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.61 
 
 		 411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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