More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1767 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
397 aa  781    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  41.79 
 
 
401 aa  290  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.3 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.77 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.77 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.77 
 
 
396 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.77 
 
 
396 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.77 
 
 
396 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.5 
 
 
396 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.41 
 
 
399 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.5 
 
 
396 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.81 
 
 
401 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  40.63 
 
 
401 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.15 
 
 
399 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.42 
 
 
396 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.13 
 
 
402 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  39.23 
 
 
400 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  39.89 
 
 
398 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  39.05 
 
 
395 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.11 
 
 
398 aa  248  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.46 
 
 
400 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.24 
 
 
396 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.24 
 
 
396 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  38.24 
 
 
396 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.24 
 
 
396 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.24 
 
 
396 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.24 
 
 
396 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.44 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.21 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.19 
 
 
498 aa  229  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.37 
 
 
406 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  35.19 
 
 
420 aa  227  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  33.69 
 
 
426 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.04 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.9 
 
 
394 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.08 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.59 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.22 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.65 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 
393 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.75 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  34.66 
 
 
392 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  34.4 
 
 
393 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.4 
 
 
393 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 
405 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  34.39 
 
 
392 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  32.43 
 
 
426 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 
405 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.78 
 
 
434 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.6 
 
 
393 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
405 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
405 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
458 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
424 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.36 
 
 
399 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 
411 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  32.1 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.87 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.16 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  33.69 
 
 
409 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.44 
 
 
405 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.74 
 
 
396 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 
414 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.71 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.21 
 
 
389 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 
400 aa  192  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.9 
 
 
406 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.04 
 
 
399 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  34.25 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.44 
 
 
416 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.43 
 
 
411 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.79 
 
 
406 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.44 
 
 
403 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.31 
 
 
399 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.91 
 
 
400 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.76 
 
 
406 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.88 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.51 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.71 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.03 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.12 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.13 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.82 
 
 
416 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.21 
 
 
412 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.07 
 
 
408 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.12 
 
 
403 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.02 
 
 
402 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.98 
 
 
408 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 
394 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_009092  Shew_1777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.11 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221977  normal 
 
 
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NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.11 
 
 
408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.05 
 
 
426 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35 
 
 
392 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 
410 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.16 
 
 
397 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  34.98 
 
 
411 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 
408 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.6 
 
 
411 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
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