More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4899 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 422 aa  828    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.84 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  50.38 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  48.61 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  49.88 
 
 		 415 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  51.65 
 
 		 415 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  49.87 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.9 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.13 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.16 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.35 
 
 		 421 aa  338  9e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.64 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.07 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.39 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.84 
 
 		 430 aa  332  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.39 
 
 		 410 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.39 
 
 		 425 aa  317  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.21 
 
 		 414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.49 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 425 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.51 
 
 		 445 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  42.6 
 
 		 388 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.49 
 
 		 430 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.54 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.78 
 
 		 413 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.69 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  41.44 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.16 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  41.16 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.37 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  35.6 
 
 		 406 aa  239  9e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 410 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.3 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.86 
 
 		 404 aa  206  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  31.82 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.75 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.12 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.67 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.4 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.65 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.72 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.91 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.48 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.83 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.58 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.65 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.65 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.02 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.39 
 
 		 405 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.23 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.22 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.71 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  30.56 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.46 
 
 		 394 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.09 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.38 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.3 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.29 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.44 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.6 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.29 
 
 		 401 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.29 
 
 		 399 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.7 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  30.51 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.6 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  30.51 
 
 		 392 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.81 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.01 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.4 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.66 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.07 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.63 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.16 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.6 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.6 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.73 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.6 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.6 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  31.6 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.6 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  32.87 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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