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for query gene Patl_4258 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 410 aa  813    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  61.46 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.95 
 
 		 422 aa  352  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.56 
 
 		 414 aa  329  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.36 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.95 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.06 
 
 		 405 aa  299  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  39.39 
 
 		 406 aa  298  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.39 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.92 
 
 		 410 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 423 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.89 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.4 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 405 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  37.37 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 425 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.09 
 
 		 421 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  38.06 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.06 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.57 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 421 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.48 
 
 		 430 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  36.73 
 
 		 401 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.99 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.74 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.75 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.19 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.3 
 
 		 415 aa  209  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.93 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.97 
 
 		 414 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.49 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.74 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.77 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.21 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.37 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  28.8 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.53 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.49 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.18 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.26 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.35 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.23 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  30.17 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.66 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.35 
 
 		 400 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.46 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.35 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.74 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 458 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.74 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.6 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.87 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.19 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.75 
 
 		 401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.05 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.53 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.03 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.13 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.94 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.84 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.72 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  28 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.01 
 
 		 396 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.01 
 
 		 396 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.3 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.58 
 
 		 396 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.01 
 
 		 396 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.01 
 
 		 396 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.97 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.57 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.23 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.23 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
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