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for query gene Pden_1778 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 404 aa  785    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  58.78 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  56.52 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  54.82 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.82 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.88 
 
 		 405 aa  363  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.84 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.89 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.8 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.25 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.21 
 
 		 420 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  39.6 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  34.68 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.84 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.27 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.47 
 
 		 414 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  36.55 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_1935  MFS permease  37.74 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.14 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.5 
 
 		 415 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.11 
 
 		 428 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.23 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.6 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.48 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 437 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.26 
 
 		 421 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.96 
 
 		 422 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.5 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.41 
 
 		 421 aa  219  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.7 
 
 		 418 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
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NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.62 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.7 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.86 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.89 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.9 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.29 
 
 		 425 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.02 
 
 		 414 aa  190  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.54 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.58 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.66 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.95 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.69 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.88 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.93 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.33 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.3 
 
 		 405 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.47 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.77 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.77 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.77 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.81 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.34 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3306  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.53 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.47 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.47 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.47 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.47 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.47 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.28 
 
 		 405 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.79 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.05 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.28 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  31.81 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.89 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.46 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.46 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.29 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.11 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.11 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.74 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.49 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.08 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.52 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.81 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.86 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.6 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.97 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
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NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  31.7 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.99 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.72 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.21 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.21 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.21 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.32 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.21 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.21 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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