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for query gene Dshi_1559 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
402 aa  780    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  61.54 
 
 
405 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.54 
 
 
405 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  62.07 
 
 
405 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.87 
 
 
405 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  55.16 
 
 
407 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.78 
 
 
404 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.28 
 
 
398 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.8 
 
 
413 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.37 
 
 
410 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.48 
 
 
420 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.44 
 
 
422 aa  249  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.52 
 
 
430 aa  245  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.96 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  38.62 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.82 
 
 
405 aa  242  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  36.36 
 
 
414 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  36.19 
 
 
406 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.62 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.32 
 
 
401 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.36 
 
 
415 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.11 
 
 
415 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.47 
 
 
428 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.76 
 
 
445 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  39.18 
 
 
423 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.32 
 
 
412 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  35.75 
 
 
416 aa  223  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.79 
 
 
430 aa  222  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.41 
 
 
414 aa  222  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.68 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.69 
 
 
421 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.06 
 
 
426 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.34 
 
 
421 aa  216  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.4 
 
 
421 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  36.48 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
461 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
397 aa  209  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
388 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  34.96 
 
 
437 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.2 
 
 
411 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.56 
 
 
417 aa  191  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.34 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
397 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.39 
 
 
401 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.39 
 
 
399 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.39 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.4 
 
 
396 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.4 
 
 
396 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.5 
 
 
438 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 
405 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 
403 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.84 
 
 
398 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.52 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.51 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.05 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.4 
 
 
396 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.4 
 
 
396 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.4 
 
 
396 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  31.4 
 
 
396 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.4 
 
 
396 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.4 
 
 
396 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.51 
 
 
434 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.69 
 
 
396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.69 
 
 
396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.69 
 
 
396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.69 
 
 
396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  39.25 
 
 
414 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.69 
 
 
396 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.18 
 
 
393 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.02 
 
 
398 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 
405 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.07 
 
 
411 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.69 
 
 
417 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.42 
 
 
405 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 
458 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 
406 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  31.58 
 
 
401 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.59 
 
 
405 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.24 
 
 
461 aa  143  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.36 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.51 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.49 
 
 
407 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  32.97 
 
 
397 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  31.06 
 
 
394 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.74 
 
 
408 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.98 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.73 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  39.37 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.91 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.09 
 
 
405 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.78 
 
 
395 aa  133  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.82 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.35 
 
 
403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.23 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.83 
 
 
403 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.48 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.29 
 
 
420 aa  130  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 
411 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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