More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002080 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  89.37 
 
 
423 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  100 
 
 
397 aa  793    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  75.06 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  63.96 
 
 
401 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.39 
 
 
400 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.13 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.89 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.37 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.35 
 
 
401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.62 
 
 
400 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  44.81 
 
 
400 aa  299  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.89 
 
 
402 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.64 
 
 
402 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.64 
 
 
402 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.64 
 
 
402 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  41.37 
 
 
400 aa  292  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.13 
 
 
402 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.13 
 
 
402 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.13 
 
 
402 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.62 
 
 
402 aa  282  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  43.28 
 
 
402 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.67 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.73 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.03 
 
 
400 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.72 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.72 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.96 
 
 
397 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.36 
 
 
392 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.33 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.33 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.82 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  32.36 
 
 
395 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.13 
 
 
395 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.63 
 
 
401 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.88 
 
 
415 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  32.36 
 
 
395 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  32.36 
 
 
395 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4235  multidrug efflux system protein MdtL  32.36 
 
 
395 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637245  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.11 
 
 
396 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  32.07 
 
 
395 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.79 
 
 
399 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  28.95 
 
 
396 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.59 
 
 
396 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  29.85 
 
 
371 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 
398 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.09 
 
 
399 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.09 
 
 
399 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  31.34 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  29.55 
 
 
371 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.65 
 
 
394 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.69 
 
 
404 aa  153  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  31.34 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  31.34 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  31.34 
 
 
391 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.49 
 
 
393 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  31.34 
 
 
391 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  31.34 
 
 
391 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  31.34 
 
 
391 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  31.34 
 
 
391 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  31.34 
 
 
391 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
391 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.49 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  28.32 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.23 
 
 
401 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.43 
 
 
396 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.43 
 
 
396 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.13 
 
 
397 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.05 
 
 
417 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.13 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.13 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  29.36 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.13 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.6 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  32.27 
 
 
400 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.15 
 
 
398 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2449  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.32 
 
 
410 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.6 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.98 
 
 
403 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.58 
 
 
414 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 
425 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.23 
 
 
424 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.45 
 
 
405 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.84 
 
 
414 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.32 
 
 
461 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1438  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.56 
 
 
412 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61616  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.45 
 
 
405 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.56 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009140  SNSL254_pSN254_0040  florfenicol/chloramphenicol resistance protein FloR  30.46 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.85 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.15 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.73 
 
 
391 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.15 
 
 
405 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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