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for query gene BBta_6060 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  100 
 
 		 414 aa  816    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  62.65 
 
 		 420 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.61 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.5 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.62 
 
 		 421 aa  345  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.95 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.72 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.37 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  47.36 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.14 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.17 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 423 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.9 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.3 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.82 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.97 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.23 
 
 		 410 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.17 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 426 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.44 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.92 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.85 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
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NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
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NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 437 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
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NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40 
 
 		 405 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
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NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.97 
 
 		 398 aa  273  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
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NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.76 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  43.5 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.5 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
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NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.26 
 
 		 422 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
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NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.75 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
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NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.32 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
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NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.7 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  34.74 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.4 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.7 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  31.96 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
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NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.41 
 
 		 458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.41 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.41 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.9 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.84 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.84 
 
 		 434 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.7 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36 
 
 		 411 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.64 
 
 		 417 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.8 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.32 
 
 		 415 aa  179  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 424 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.22 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.16 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.46 
 
 		 426 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.64 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.64 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.77 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.64 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.64 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.92 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.95 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.2 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.41 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.05 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.04 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.2 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.99 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.63 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.63 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.78 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.05 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.48 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.48 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.12 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.66 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.87 
 
 		 416 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.7 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.97 
 
 		 393 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.93 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.23 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.91 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.99 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.19 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.49 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.83 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.65 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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