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for query gene Bphyt_3096 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 
406 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  96.78 
 
 
416 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  83.79 
 
 
402 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  75.37 
 
 
405 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.32 
 
 
405 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.32 
 
 
405 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.07 
 
 
405 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.32 
 
 
434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.83 
 
 
458 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.83 
 
 
405 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.87 
 
 
411 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  73.4 
 
 
411 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.4 
 
 
411 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.4 
 
 
411 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.92 
 
 
400 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.92 
 
 
400 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.92 
 
 
400 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.92 
 
 
400 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  49.18 
 
 
414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  50.57 
 
 
402 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  40.16 
 
 
420 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  38.16 
 
 
426 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.65 
 
 
420 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.03 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.75 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.75 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.75 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  39.35 
 
 
402 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.09 
 
 
401 aa  252  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  38.87 
 
 
393 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  39.13 
 
 
409 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.87 
 
 
393 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.13 
 
 
393 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.79 
 
 
393 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.9 
 
 
407 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.27 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.86 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.18 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.46 
 
 
398 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.16 
 
 
396 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.16 
 
 
396 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.1 
 
 
411 aa  239  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 
398 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.16 
 
 
396 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.16 
 
 
396 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.16 
 
 
396 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.16 
 
 
396 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.16 
 
 
396 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.44 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.44 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  36.44 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.44 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.44 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.44 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.33 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  38.46 
 
 
392 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  37.74 
 
 
400 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  38.73 
 
 
392 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  36.06 
 
 
398 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.81 
 
 
395 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.33 
 
 
401 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  38.04 
 
 
400 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.46 
 
 
392 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 
409 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.48 
 
 
396 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.68 
 
 
424 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.53 
 
 
498 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.33 
 
 
410 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.47 
 
 
406 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.98 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.53 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.11 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.62 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 
397 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.37 
 
 
412 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.01 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.46 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.21 
 
 
461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.11 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.9 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.17 
 
 
403 aa  212  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.18 
 
 
405 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.04 
 
 
394 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.13 
 
 
436 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  35.84 
 
 
407 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.54 
 
 
418 aa  210  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.16 
 
 
413 aa  209  6e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.05 
 
 
400 aa  209  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.11 
 
 
399 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.49 
 
 
412 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.26 
 
 
409 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
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NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.5 
 
 
384 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  34.32 
 
 
426 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.94 
 
 
416 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.94 
 
 
398 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3182  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.43 
 
 
395 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.43 
 
 
409 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.1 
 
 
418 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.19 
 
 
408 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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