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for query gene Sama_2017 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  100 
 
 		 401 aa  793    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  63.84 
 
 		 408 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  63.98 
 
 		 408 aa  482  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2136  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  65.7 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.05 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2488  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.91 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0118329  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.23 
 
 		 408 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1974  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  64.91 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0583224  hitchhiker  0.00000495427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.91 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2373  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  63.92 
 
 		 407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.409175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.62 
 
 		 406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1751  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.54 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0172421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2268  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.29 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1831  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.54 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2280  bicyclomycin resistance protein  63.78 
 
 		 407 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  61.58 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4611  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  49.6 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.64 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.25 
 
 		 401 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.42 
 
 		 399 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.42 
 
 		 399 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.33 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.76 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.14 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.24 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.42 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.7 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  33.86 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.47 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.47 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.49 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.47 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.47 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.65 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.22 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  33.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.52 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.07 
 
 		 396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.92 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.92 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.49 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.64 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.42 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.92 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.05 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.92 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.55 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.68 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.56 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.56 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.77 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  34.15 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.13 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.65 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.49 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.89 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.75 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30.46 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.22 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.8 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.25 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.51 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1316  major facilitator superfamily permease  32.56 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 411 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.88 
 
 		 392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.6 
 
 		 412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.24 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.08 
 
 		 418 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.95 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.23 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.24 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.07 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.34 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.27 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.63 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.68 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.11 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.58 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  35.15 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.51 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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