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for query gene Lcho_0511 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 409 aa  796    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.74 
 
 		 410 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  68.45 
 
 		 409 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
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NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  68.7 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  67.68 
 
 		 411 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  65.33 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  65.9 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  69.72 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  69.72 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  63.87 
 
 		 353 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
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NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.92 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
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NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.05 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
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NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.94 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1038  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  48.35 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1035  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.75 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.11 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.11 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.36 
 
 		 418 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.23 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.08 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
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NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.87 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  38.58 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.61 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.42 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  38 
 
 		 414 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.29 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.51 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.31 
 
 		 399 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.96 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.96 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  38.01 
 
 		 402 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  35.9 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  35.9 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.69 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.55 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.55 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.36 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.36 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.5 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.36 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.08 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.08 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.08 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.08 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.08 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.08 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  35.08 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.08 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.49 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.5 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.76 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.5 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.97 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.96 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.17 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.81 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.5 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.22 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.22 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.22 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.25 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.25 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.1 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.82 
 
 		 412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.95 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.95 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.52 
 
 		 393 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.86 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.4 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.8 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.3 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.76 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.23 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.64 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.49 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.98 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.56 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.25 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.77 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  33.43 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.44 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.06 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.08 
 
 		 399 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.79 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.97 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.6 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.64 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.83 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.08 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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