More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2329 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 408 aa  808    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  83.08 
 
 		 408 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  68.39 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  68.39 
 
 		 410 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  68.39 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  68.13 
 
 		 410 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  68.13 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  67.19 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  67.1 
 
 		 414 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  66.84 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  65.8 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  47.3 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  46.68 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  46.63 
 
 		 401 aa  328  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  45.5 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  42.86 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  42.22 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  42.09 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  42.49 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  42.24 
 
 		 386 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  42.24 
 
 		 386 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  42.2 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  42.2 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  42.2 
 
 		 394 aa  259  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  42.2 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  42.2 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  42.2 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  42.2 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  42.2 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  41.95 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  42.2 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  29.23 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 391 aa  156  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.53 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  28.53 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.8 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.89 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.72 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.61 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.96 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  26.65 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.62 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  30.09 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  26.9 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.29 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  27.56 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.63 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.68 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  30.4 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.71 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.14 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.64 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  28.18 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.3 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.14 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.99 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.68 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  28.45 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.49 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.95 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.19 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.54 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.05 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.74 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  28.01 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.98 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  29.19 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.7 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.45 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.34 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.34 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.26 
 
 		 420 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.45 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.45 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.59 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.63 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.63 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.21 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.26 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.84 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>