More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1015 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 414 aa  817    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  75.81 
 
 		 401 aa  619  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  77.81 
 
 		 401 aa  597  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  71.07 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  45.9 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  46.28 
 
 		 408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  42.01 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  41.97 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  41.97 
 
 		 414 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  41.96 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  43.59 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  42.05 
 
 		 410 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  41.54 
 
 		 410 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  41.54 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  41.45 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  43.8 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  43.68 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  43.39 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  43.35 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  43.06 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  41.78 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  43.1 
 
 		 394 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.64 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  41.62 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  41.62 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  41.62 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  41.62 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
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NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  41.62 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  41.62 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  41.62 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  42.49 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  30.9 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  33.15 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  33.15 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.51 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.04 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  28.3 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  28.24 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.67 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  26.02 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.08 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.14 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.65 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.44 
 
 		 403 aa  136  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  29.12 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.19 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.37 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.94 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  26.85 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.89 
 
 		 400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.61 
 
 		 405 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.92 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  26.42 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  27.76 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.89 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  26.8 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.81 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.11 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  26.96 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.71 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  30.03 
 
 		 397 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.09 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.7 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.94 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.93 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  29.43 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.93 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.93 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.93 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  27.21 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.04 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.33 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  27.21 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.86 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.53 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  29.65 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.41 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.37 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  25.89 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.01 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.81 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.81 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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