More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001431 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 397 aa  785    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  83.72 
 
 		 387 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  66.67 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  62.6 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  32.53 
 
 		 394 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  34.2 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  33.67 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_2799  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 407 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.37 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.94 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.29 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.5 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.5 
 
 		 458 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.79 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.67 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.92 
 
 		 405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.36 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  30.46 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.43 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.12 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.92 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.18 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.07 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.45 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  29.2 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  30.81 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.3 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.9 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.81 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  31.05 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.36 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.99 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.92 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.88 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.4 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  31.03 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.25 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.67 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.24 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.64 
 
 		 418 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.11 
 
 		 411 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  30.55 
 
 		 410 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  30.55 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.79 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  29.97 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.16 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  30.42 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  30.42 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  29.38 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.8 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  31.2 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  26.74 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.42 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  27.64 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  28.75 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  29.38 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  29.38 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  29.38 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  29.38 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  29.38 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  29.38 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.06 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  29.38 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.67 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  27.45 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  27.45 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.84 
 
 		 411 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  27.45 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  27.45 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  27.45 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  27.45 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  27.45 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.9 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  29.2 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.45 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.7 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  29.24 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.76 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  29.2 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  29.08 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.74 
 
 		 394 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.47 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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