More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5141 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  97.95 
 
 
391 aa  759    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  98.21 
 
 
391 aa  760    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  97.95 
 
 
391 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  97.95 
 
 
391 aa  759    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  98.47 
 
 
391 aa  761    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  97.95 
 
 
391 aa  759    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  98.21 
 
 
391 aa  761    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  100 
 
 
391 aa  774    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  97.95 
 
 
391 aa  759    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  78.63 
 
 
395 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  78.63 
 
 
395 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  78.37 
 
 
395 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  78.37 
 
 
395 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4235  multidrug efflux system protein MdtL  78.12 
 
 
395 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637245  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  72.61 
 
 
391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  61.99 
 
 
396 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  57.07 
 
 
396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  57.58 
 
 
396 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.72 
 
 
400 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 
400 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.59 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.75 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  31.25 
 
 
400 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.01 
 
 
400 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  31.16 
 
 
401 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  31.34 
 
 
423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  31.34 
 
 
397 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
401 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.93 
 
 
402 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.56 
 
 
402 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.93 
 
 
402 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.56 
 
 
402 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.56 
 
 
402 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.56 
 
 
402 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.59 
 
 
402 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.81 
 
 
402 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 
402 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  31.75 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.76 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
397 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.27 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  30.15 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.75 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.18 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  26.56 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.25 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30.47 
 
 
402 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.5 
 
 
396 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  28.16 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.16 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.14 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.09 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.32 
 
 
399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.58 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.05 
 
 
402 aa  116  6e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.82 
 
 
401 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.62 
 
 
393 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.85 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.78 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.75 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.57 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.74 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.9 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 
440 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.91 
 
 
386 aa  114  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.79 
 
 
404 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 
430 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.07 
 
 
399 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 
429 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  27.03 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.15 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.57 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  30.86 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  28.81 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.51 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.29 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 
419 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.51 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.93 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.18 
 
 
418 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  30.96 
 
 
419 aa  110  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  29.25 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.91 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.35 
 
 
412 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 
444 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 
403 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.91 
 
 
411 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 
394 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.54 
 
 
409 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.83 
 
 
398 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  28.91 
 
 
422 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.27 
 
 
409 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 
421 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  28.74 
 
 
394 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.75 
 
 
401 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 
412 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
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