More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001081 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  100 
 
 
394 aa  789    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  85.28 
 
 
394 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  78.97 
 
 
399 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  36.18 
 
 
403 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  36.31 
 
 
394 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  31.87 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  34.2 
 
 
397 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.49 
 
 
391 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  31.49 
 
 
409 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  31.16 
 
 
414 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  31.36 
 
 
414 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  29.24 
 
 
408 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  30.06 
 
 
410 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  29.81 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  30.59 
 
 
414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  29.81 
 
 
410 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  29.53 
 
 
410 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  30.75 
 
 
401 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.48 
 
 
394 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  28.88 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  28.05 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.44 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.88 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  29.63 
 
 
400 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.77 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  26.87 
 
 
414 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  28.77 
 
 
408 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2799  major facilitator transporter  27.58 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  29.2 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.77 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.64 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  33.7 
 
 
420 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.11 
 
 
417 aa  126  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  33.08 
 
 
415 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.02 
 
 
399 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.02 
 
 
401 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.02 
 
 
399 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.17 
 
 
405 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  32.96 
 
 
394 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.58 
 
 
469 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.96 
 
 
452 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.79 
 
 
398 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  33.08 
 
 
415 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  33.08 
 
 
415 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  33.08 
 
 
415 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  25.06 
 
 
401 aa  123  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.28 
 
 
405 aa  123  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.49 
 
 
402 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.49 
 
 
402 aa  122  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  34.73 
 
 
403 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.95 
 
 
398 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.38 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  33.08 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  35.65 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.7 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.07 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  26.24 
 
 
392 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.1 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.91 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.13 
 
 
396 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.01 
 
 
444 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.22 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  32.7 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.23 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.69 
 
 
408 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.79 
 
 
416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.14 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0064  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.834024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.05 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.83 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.18 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.28 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.79 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.18 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.08 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.18 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 
396 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.18 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.51 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.18 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4471  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.65 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.87 
 
 
413 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.86 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.28 
 
 
407 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.73 
 
 
396 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.73 
 
 
396 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  28.57 
 
 
402 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.73 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.73 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  24.73 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.48 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.03 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.8 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.73 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.73 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  28.33 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.73 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.28 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>