More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1947 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  100 
 
 		 403 aa  777    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  68.41 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  68.41 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2460  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.87 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154885  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.87 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2014  bicyclomycin resistance protein  47.58 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0373482  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  41.93 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.2 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.45 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.45 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  42.19 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.69 
 
 		 419 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  41.93 
 
 		 416 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  42.19 
 
 		 416 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.1 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.24 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.75 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.02 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.39 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.3 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  39.29 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.61 
 
 		 424 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.32 
 
 		 412 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.88 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.5 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  38.56 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  36.64 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  34.77 
 
 		 411 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.85 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  36.09 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.84 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.52 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.66 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.83 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.96 
 
 		 414 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.52 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.16 
 
 		 425 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.48 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.48 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.63 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.73 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.78 
 
 		 414 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.63 
 
 		 392 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.04 
 
 		 457 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.41 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.46 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_013235  Namu_1251  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.03 
 
 		 410 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0659251  normal  0.330934 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.66 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.16 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.74 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.4 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.95 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.69 
 
 		 434 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.65 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.56 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  31.36 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.85 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.11 
 
 		 398 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.97 
 
 		 412 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.3 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.9 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.51 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.4 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.47 
 
 		 399 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.51 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.66 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.76 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.86 
 
 		 458 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.07 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.64 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.72 
 
 		 412 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.1 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.28 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.17 
 
 		 398 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.39 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.91 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.85 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.85 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.85 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.91 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  31.91 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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