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for query gene PputW619_4515 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 396 aa  772    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  33 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  33 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  33 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  32.36 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.98 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  30.57 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.4 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  30.39 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  26.94 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.97 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.97 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.72 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.72 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.72 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  25.19 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  24.42 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.57 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  27.89 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.18 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.14 
 
 		 394 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.53 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  29.7 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.3 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.82 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.53 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.68 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.68 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.25 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.68 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.86 
 
 		 398 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  26.2 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  28.49 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.4 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.51 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.64 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.38 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.6 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.92 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.33 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.49 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 		 412 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.26 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.26 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.26 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  24.29 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  28.26 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.86 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.26 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.26 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.57 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.86 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.75 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.94 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.56 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.48 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  28.25 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  26.63 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  28.76 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.27 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.27 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.44 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.44 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  25.59 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.09 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  23.45 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.37 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
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NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.51 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.54 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.25 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.06 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  29.02 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.91 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  26.99 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 425 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 458 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.41 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  29.55 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.17 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.84 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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