More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3211 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
424 aa  837    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  75 
 
 
408 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.06 
 
 
465 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  64.4 
 
 
418 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.27 
 
 
418 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  66.07 
 
 
394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60.32 
 
 
395 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  54.64 
 
 
413 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1286  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  52.56 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000624071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.62 
 
 
406 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4433  major facilitator transporter  41.55 
 
 
415 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.944293  normal  0.4083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.03 
 
 
394 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4301  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 
396 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555384  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4411  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 
396 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5533  major facilitator transporter  38.76 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.748731  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5897  major facilitator transporter  38.76 
 
 
410 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.733334 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6406  major facilitator transporter  38.76 
 
 
410 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671543  normal  0.868743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.96 
 
 
392 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.12 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.4 
 
 
405 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 
405 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 
458 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 
405 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 
405 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 
405 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.58 
 
 
434 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.14 
 
 
414 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  34.43 
 
 
404 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  33.24 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  33.24 
 
 
403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30.11 
 
 
420 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.24 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.97 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  32.96 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.8 
 
 
452 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.59 
 
 
411 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.52 
 
 
411 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.18 
 
 
411 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.73 
 
 
417 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.14 
 
 
411 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.58 
 
 
407 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.66 
 
 
393 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.81 
 
 
393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  34.62 
 
 
426 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.2 
 
 
407 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.69 
 
 
435 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.28 
 
 
393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.28 
 
 
393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  29.91 
 
 
407 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  32.43 
 
 
403 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1103  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.26 
 
 
399 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278959  decreased coverage  0.00752766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 
413 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.6 
 
 
440 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 
424 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.9 
 
 
409 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.43 
 
 
410 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.53 
 
 
415 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.05 
 
 
424 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.25 
 
 
392 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.71 
 
 
409 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.25 
 
 
392 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.79 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.86 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.79 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.79 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.86 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.79 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 
398 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  33.73 
 
 
392 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.86 
 
 
419 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.47 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.55 
 
 
411 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.01 
 
 
401 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.61 
 
 
411 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.71 
 
 
398 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.86 
 
 
405 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0384  bicyclomycin resistance protein  32.17 
 
 
400 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 
401 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.26 
 
 
425 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.17 
 
 
401 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.09 
 
 
400 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.68 
 
 
399 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.55 
 
 
425 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.6 
 
 
402 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.14 
 
 
413 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.17 
 
 
399 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.89 
 
 
411 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.25 
 
 
399 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  34.23 
 
 
414 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  31.53 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.91 
 
 
400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.77 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.33 
 
 
420 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.11 
 
 
393 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  33.71 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.75 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>