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for query gene Rfer_1536 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 408 aa  790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.43 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  64.22 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  65.17 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  65.17 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  64.88 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.53 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  60.05 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1286  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.52 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000624071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4433  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.944293  normal  0.4083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.53 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4301  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4411  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5533  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.748731  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5897  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.733334 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6406  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671543  normal  0.868743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.6 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.51 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30.29 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.98 
 
 		 458 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.96 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.96 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  33.24 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  33.24 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.2 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.52 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.12 
 
 		 405 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.69 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.4 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.46 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.56 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.84 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.97 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.58 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.29 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.69 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  29.49 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  32.69 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.9 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.62 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.38 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.38 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.15 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
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NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  29.21 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.15 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.14 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.25 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.25 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1103  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.14 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278959  decreased coverage  0.00752766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.38 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.69 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.14 
 
 		 461 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  37 
 
 		 402 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  32.14 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.58 
 
 		 411 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 411 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.1 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.1 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.6 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.1 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.77 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  31.8 
 
 		 400 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.95 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  37.42 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.15 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.73 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.8 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.17 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.98 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.87 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.07 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.1 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.83 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.53 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.89 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.19 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.57 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.08 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.91 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.3 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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