More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4129 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  92.53 
 
 
394 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  92.69 
 
 
383 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  92.53 
 
 
394 aa  644    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  99.74 
 
 
394 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  100 
 
 
386 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  92.53 
 
 
394 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  99.48 
 
 
386 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  92.53 
 
 
396 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  92.53 
 
 
394 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  99.48 
 
 
394 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  92 
 
 
394 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  92.53 
 
 
394 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  92.53 
 
 
394 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  99.22 
 
 
394 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  90.13 
 
 
394 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  73.83 
 
 
394 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  44.84 
 
 
400 aa  302  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  41.82 
 
 
401 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  44.16 
 
 
410 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  44.16 
 
 
410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  44.16 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  43.9 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  42.59 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  45.09 
 
 
414 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  41.78 
 
 
408 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  43.13 
 
 
414 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  44.3 
 
 
414 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  44.3 
 
 
414 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  43.12 
 
 
422 aa  279  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  43.21 
 
 
401 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  43.48 
 
 
414 aa  270  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.35 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  29.08 
 
 
409 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.81 
 
 
392 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  28.5 
 
 
397 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  29.92 
 
 
394 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.53 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.63 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  29.91 
 
 
387 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  29.21 
 
 
400 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.38 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.69 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.79 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.09 
 
 
412 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  27.74 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  27.42 
 
 
407 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.92 
 
 
405 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.43 
 
 
412 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.26 
 
 
407 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.56 
 
 
389 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.75 
 
 
410 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.5 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.3 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.13 
 
 
398 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  26.5 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.12 
 
 
413 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.96 
 
 
403 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.49 
 
 
407 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.89 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  28.66 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  28.66 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.66 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.66 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.66 
 
 
403 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  28.96 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  27.81 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  27.81 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  27.81 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.07 
 
 
409 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 
405 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.66 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.01 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.53 
 
 
469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.23 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  30.43 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.03 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.39 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.600108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.37 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.72 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.75 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.49 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.44 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.7 
 
 
399 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.44 
 
 
411 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 
401 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.701434 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 
434 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.25 
 
 
411 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
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NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.57 
 
 
396 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
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