More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02683 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  804    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  27.87 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.87 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  28.46 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  28.08 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.23 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  29.49 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.21 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  30 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  27.25 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.86 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.59 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  29.28 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.48 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.61 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  27.16 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.05 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  27.81 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.92 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  26.2 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  25.89 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  27.32 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  28.87 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.1 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  31.43 
 
 		 420 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  29.65 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.04 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  27.63 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  26.77 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  29.25 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.25 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  29.25 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  29.25 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  29.25 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  29.25 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.94 
 
 		 412 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.59 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  29 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  28.96 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.73 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  29.25 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.96 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.2 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  24.01 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.41 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  29.53 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 411 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.4 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  32.33 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.79 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.57 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.17 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.89 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.2 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  28.07 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.45 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  28.07 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.09 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  35.44 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.41 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.35 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.55 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  26.54 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  26.48 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.33 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  30.03 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  24.25 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.91 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  29.17 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.92 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.73 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  30.03 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.29 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.81 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  26.48 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.62 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.05 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  26.55 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  23.28 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.42 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  26.48 
 
 		 386 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.84 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  26.48 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  26.48 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  26.76 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  28.87 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>