More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01631 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  100 
 
 		 403 aa  802    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  99.75 
 
 		 403 aa  800    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  100 
 
 		 403 aa  802    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  99.26 
 
 		 403 aa  795    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  85.11 
 
 		 401 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  100 
 
 		 403 aa  802    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  85.36 
 
 		 401 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1915  inner membrane transport protein YdhC  85.36 
 
 		 401 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04399  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  99.75 
 
 		 403 aa  801    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  85.36 
 
 		 401 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  85.61 
 
 		 401 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  802    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  99.75 
 
 		 403 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  100 
 
 		 403 aa  802    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  79.3 
 
 		 399 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  65.8 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  65.8 
 
 		 400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  65.54 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  63.57 
 
 		 402 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  41.95 
 
 		 423 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2062  inner membrane transport protein YdhC  41.95 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0300208  hitchhiker  0.0000445081 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1975  inner membrane transport protein YdhC  41.69 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00432346  normal  0.238152 
 
 
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NC_004347  SO_2373  inner membrane transport protein YdhC  43.07 
 
 		 423 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_2471  inner membrane transport protein YdhC  42.78 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000730777  hitchhiker  0.00484475 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00416  inner membrane transport protein YdhC  45.51 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2138  inner membrane transport protein YdhC  45.17 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.030791  normal  0.0211298 
 
 
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NC_008345  Sfri_0922  inner membrane transport protein YdhC  40.91 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_2311  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 		 423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216874  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2531  inner membrane transport protein YdhC  46.41 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_2203  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00024069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1999  inner membrane transport protein YdhC  41.98 
 
 		 424 aa  272  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00228821  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002035  multidrug resistance protein  44.94 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_2203  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 		 423 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000782097  normal  0.105834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2168  inner membrane transport protein YdhC  42.78 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00660024  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  40 
 
 		 433 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0622951 
 
 
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NC_009901  Spea_2113  inner membrane transport protein YdhC  42.78 
 
 		 414 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0214399  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_2012  inner membrane transport protein YdhC  41.02 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383533  normal  0.0277688 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.63 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.82 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.06 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.57 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.68 
 
 		 409 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 		 414 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.96 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.01 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  30.23 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.46 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.02 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.04 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  29.28 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.97 
 
 		 413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.56 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.97 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.18 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 		 458 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.28 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.14 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  32.58 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.75 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.99 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.01 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.51 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.19 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.19 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.16 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.48 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.22 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.9 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.83 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  32.2 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  32.77 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 		 405 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.06 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.08 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_011989  Avi_4159  MFS permease  28.24 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  34.03 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.08 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.86 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.03 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.03 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.35 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.63 
 
 		 416 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.03 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.19 
 
 		 398 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.89 
 
 		 434 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.55 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.39 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.22 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.22 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  28.47 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.49 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
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