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for query gene Vapar_1761 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 		 411 aa  813    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  79.9 
 
 		 409 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  80.25 
 
 		 410 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  79.36 
 
 		 408 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.28 
 
 		 412 aa  631  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.07 
 
 		 410 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  72.1 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  72.35 
 
 		 411 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  67.68 
 
 		 409 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  72.73 
 
 		 353 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.23 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.85 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.54 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.26 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.87 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.06 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.73 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1038  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.2 
 
 		 412 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1035  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.2 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.88 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.41 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.91 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.81 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  38.83 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.92 
 
 		 393 aa  199  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.91 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.66 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.79 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.79 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.09 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.64 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  36.64 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.29 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  35 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.73 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  36.33 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.36 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  36.46 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.31 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.23 
 
 		 396 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.55 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.24 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.24 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.24 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.24 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.24 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.24 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.24 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  34.51 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.16 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.95 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.9 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.77 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.9 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.57 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.85 
 
 		 396 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.38 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.96 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.96 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  34.96 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.96 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.96 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.96 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.59 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.47 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.45 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.61 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.51 
 
 		 420 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.94 
 
 		 412 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.24 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.49 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.73 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.82 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.49 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.18 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.24 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.15 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.15 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.15 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.15 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.15 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.13 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.15 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.15 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.52 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.83 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.63 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.68 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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