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for query gene Rfer_1220 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 412 aa  810    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.7 
 
 		 409 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  80.3 
 
 		 410 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.21 
 
 		 408 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  77.28 
 
 		 411 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  72.59 
 
 		 410 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  73.59 
 
 		 411 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.84 
 
 		 411 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  65.33 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  69.6 
 
 		 353 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
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NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.58 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.2 
 
 		 400 aa  299  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.04 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.78 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.11 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.09 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.85 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.67 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1035  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.41 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1038  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.41 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.614321  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.58 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.57 
 
 		 419 aa  226  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  39.21 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.67 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.5 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.92 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.87 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.92 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.33 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.04 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.23 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.81 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.27 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003780  permease  33.71 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.05 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.59 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.07 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.3 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.26 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.12 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  34.35 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.33 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.57 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  34.93 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.36 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.62 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.36 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  34.67 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.97 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.81 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.42 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.33 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.81 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.13 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.81 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.81 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.81 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.15 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.81 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.23 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.15 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.81 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.47 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.87 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.51 
 
 		 396 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.51 
 
 		 396 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.25 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  29.1 
 
 		 419 aa  159  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.73 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.71 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.38 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.12 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.4 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.39 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.38 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.39 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.3 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.59 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.39 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.47 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.34 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.59 
 
 		 416 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.45 
 
 		 396 aa  156  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  32.85 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.44 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.23 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.85 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.85 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.47 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.79 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.16 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.79 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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