50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49971 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  100 
 
 		 957 aa  1969    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 384 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32319  MFS family transporter: metabolite  23.08 
 
 		 462 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.133005 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  21.51 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 395 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 394 aa  67  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  31.47 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  32.09 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50201  predicted protein  22.34 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1158  hypothetical protein  21.88 
 
 		 330 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 387 aa  61.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  27.07 
 
 		 183 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  29.46 
 
 		 389 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 390 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  20.6 
 
 		 386 aa  56.2  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.93 
 
 		 384 aa  55.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  19.18 
 
 		 388 aa  54.7  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 381 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  28.91 
 
 		 382 aa  53.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 384 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  29.77 
 
 		 386 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 384 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 387 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  31.34 
 
 		 387 aa  52.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 387 aa  52.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 384 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 389 aa  52  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 402 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  29.84 
 
 		 354 aa  50.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  27.07 
 
 		 384 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  21.71 
 
 		 399 aa  50.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  26.28 
 
 		 395 aa  50.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 384 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 402 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  25.14 
 
 		 400 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 419 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 385 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  22.36 
 
 		 382 aa  47  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 397 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 385 aa  45.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  27.87 
 
 		 386 aa  45.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 400 aa  44.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  30.71 
 
 		 380 aa  44.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  28.36 
 
 		 415 aa  44.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>