208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10750 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
378 aa  743    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
385 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  28.57 
 
 
391 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  25.88 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  26.51 
 
 
390 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  27.35 
 
 
387 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  27.41 
 
 
384 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  27.83 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  28.82 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  28.82 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.29 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  26.39 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  26.45 
 
 
389 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  25.34 
 
 
387 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  25.42 
 
 
402 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  26.38 
 
 
384 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  25.52 
 
 
389 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  27.59 
 
 
381 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
385 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.66 
 
 
384 aa  123  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  27.27 
 
 
386 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  25.6 
 
 
380 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  24.71 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  24.71 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  24.71 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  24.12 
 
 
389 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  25.77 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  27.01 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  23.82 
 
 
389 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  23.82 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.29 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  23.82 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  25.95 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
384 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  27.09 
 
 
384 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  28.29 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.51 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  24.71 
 
 
385 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  25.07 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  25.48 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.45 
 
 
393 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.69 
 
 
379 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  24.93 
 
 
389 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  25.79 
 
 
385 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.69 
 
 
379 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.69 
 
 
379 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.69 
 
 
379 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  24.86 
 
 
382 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.33 
 
 
379 aa  106  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.69 
 
 
379 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.62 
 
 
396 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  26.07 
 
 
395 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  25 
 
 
387 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  25.97 
 
 
387 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  23.98 
 
 
383 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
405 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.47 
 
 
342 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  26.63 
 
 
397 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.75 
 
 
386 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
391 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.59 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  25.07 
 
 
354 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  24.28 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  24.53 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  26.23 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  23.53 
 
 
384 aa  96.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.31 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.31 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.92 
 
 
385 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  25.07 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  24.23 
 
 
397 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.84 
 
 
383 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.08 
 
 
422 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.21 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
388 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.71 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  31.51 
 
 
183 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  24.93 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.93 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  21.02 
 
 
407 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  22.8 
 
 
395 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  24.93 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.93 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.93 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.93 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.93 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  21.19 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  24.85 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>