182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0703 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  100 
 
 		 382 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  46.07 
 
 		 386 aa  298  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  45.91 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  42.32 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 385 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  45.1 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  45.53 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  44.75 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  42.58 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  39.27 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  37.93 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  37.23 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  42.64 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 405 aa  212  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  34.04 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  34.56 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  34.26 
 
 		 422 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.65 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.65 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.38 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.1 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0045  putative MFS metabolite transporter  27.32 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 395 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.65 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.65 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.65 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.65 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.65 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.6 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.69 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  27.42 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.87 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.61 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.74 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  28.05 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  26.67 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.67 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  26.67 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.87 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.67 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.67 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.67 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.86 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  28.85 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  28.57 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>