157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1269 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  99.74 
 
 		 385 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  99.48 
 
 		 385 aa  754    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  100 
 
 		 385 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  78.1 
 
 		 383 aa  571  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  72.22 
 
 		 386 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  71.65 
 
 		 386 aa  544  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  69.21 
 
 		 379 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  68.6 
 
 		 379 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  68.6 
 
 		 379 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  68.6 
 
 		 379 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  68.6 
 
 		 379 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  68.07 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.63 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  66.05 
 
 		 379 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  66.58 
 
 		 379 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  66.58 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  66.58 
 
 		 379 aa  494  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  66.58 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  66.58 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  66.58 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.11 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  66.58 
 
 		 379 aa  494  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  63.95 
 
 		 380 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  43.09 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  43.12 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  41.58 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  41.43 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.29 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  30.66 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  33.98 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  33.62 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  32.79 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  30.31 
 
 		 386 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  29.65 
 
 		 382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  29.34 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  27.3 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  29.11 
 
 		 384 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 391 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  28.08 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  31.06 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  31.46 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  30.62 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  28.65 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  26.33 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  27.22 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  29.68 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  29 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>