122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1284 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  100 
 
 		 399 aa  803    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.16 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.36 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.36 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.36 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.36 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.01 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.1 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.33 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  35.98 
 
 		 386 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.77 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  32.3 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.3 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.2 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.29 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.28 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.25 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.01 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  33.6 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.6 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.6 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.6 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.83 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.33 
 
 		 379 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  33.33 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.33 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.15 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.33 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  27.15 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  26.11 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  26.38 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  25.27 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  25.22 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 374 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  23.65 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  25.9 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  25.71 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.77 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  23.74 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2283  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  23.96 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.26 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  26.65 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  23.28 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0757  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>