170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2089 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  100 
 
 
386 aa  772    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  33.24 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
385 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  30.16 
 
 
382 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  31.46 
 
 
384 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  33.05 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  32.47 
 
 
380 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  33.33 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  31.66 
 
 
382 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  29.44 
 
 
386 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
389 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  27.08 
 
 
383 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
384 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  31.74 
 
 
381 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  29.8 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  30.81 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  31.74 
 
 
384 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  30.05 
 
 
389 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  32.77 
 
 
390 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  31.73 
 
 
365 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  29.65 
 
 
389 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  29.65 
 
 
389 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  29.82 
 
 
391 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  30.27 
 
 
402 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  31.93 
 
 
384 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  29.56 
 
 
391 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
391 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  29.38 
 
 
389 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  29.31 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  31.18 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.85 
 
 
422 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  31.64 
 
 
365 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  29.71 
 
 
391 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  29.43 
 
 
390 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  29.26 
 
 
389 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  28.76 
 
 
387 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  28.95 
 
 
389 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  31.33 
 
 
387 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  29.1 
 
 
387 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  30.12 
 
 
380 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
396 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  27.63 
 
 
389 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
385 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  32.23 
 
 
354 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  29.49 
 
 
384 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  30.34 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  27.65 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  28.8 
 
 
384 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  26.57 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  26.22 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.92 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.38 
 
 
379 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.38 
 
 
379 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.38 
 
 
379 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.38 
 
 
379 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.38 
 
 
379 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.3 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
378 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  26.7 
 
 
387 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31 
 
 
379 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  26.14 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.56 
 
 
379 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  27.37 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  29.3 
 
 
379 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.3 
 
 
379 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.3 
 
 
379 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.3 
 
 
379 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  29.68 
 
 
379 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  29.68 
 
 
379 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.68 
 
 
379 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.76 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.39 
 
 
397 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
401 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  25.98 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.07 
 
 
383 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  27.03 
 
 
397 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
396 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.32 
 
 
385 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.32 
 
 
385 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.04 
 
 
385 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.22 
 
 
380 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.32 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  24.49 
 
 
407 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  27.33 
 
 
380 aa  94  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  27.16 
 
 
395 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  23.56 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  24.2 
 
 
384 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.3 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2283  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.74 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.37 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>