211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0526 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  81.6 
 
 		 183 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  30 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  27.43 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  22.59 
 
 		 957 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.07 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  25 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  28.81 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.85 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.58 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.58 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  25.66 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  25.92 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.54 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  25.49 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.48 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  24.8 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  25.42 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  27.95 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.28 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.29 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  25.5 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  28.53 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  23.6 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  25.6 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  27.01 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.82 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1158  hypothetical protein  32.21 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  25.07 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.1 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.15 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  24.36 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  25 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.99 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  24.72 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.81 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.72 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.72 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  26.23 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.72 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.72 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.67 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.67 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>