129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1592 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
391 aa  753    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  25.14 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
394 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  27.05 
 
 
387 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
394 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
385 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  28.53 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  25.65 
 
 
395 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.26 
 
 
395 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  27.46 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  25.66 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  24.06 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  23.91 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.15 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  29.06 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.43 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  24.2 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.1 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  24.48 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  24.14 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  24.48 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  24.48 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.51 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  23.33 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  24.48 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  24.85 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  23.16 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  22.62 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  28.77 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.43 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  24.85 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  23.97 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  24.85 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  24.85 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  26.12 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  25.69 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  24.33 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.06 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  23.46 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.97 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  25.97 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.97 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.97 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.46 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.63 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  26.49 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  23.06 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.49 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  26.49 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.85 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.85 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.85 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  22.62 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  25.41 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  23.91 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  24.29 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.92 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
402 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  21.73 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  23.59 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  24.92 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  27.07 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.09 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.97 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  24.93 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  24.39 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  28.13 
 
 
397 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  25.41 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  25.21 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  25.15 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  25.37 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  24.93 
 
 
384 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.59 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.03 
 
 
397 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  25.96 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  22.8 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  21.93 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  26.77 
 
 
448 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  22.47 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.95 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.95 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  24.84 
 
 
183 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  24.29 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.04 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.57 
 
 
385 aa  53.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.12 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  22.83 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  19.9 
 
 
402 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>