86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0665 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  361  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  81.6 
 
 		 384 aa  255  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 378 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  36.99 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 383 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 382 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 391 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.71 
 
 		 384 aa  64.7  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 394 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 385 aa  61.6  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 365 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 389 aa  61.6  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  27.07 
 
 		 957 aa  61.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 396 aa  61.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  31.76 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.48 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 390 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 385 aa  57.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  31.51 
 
 		 383 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32319  MFS family transporter: metabolite  31.17 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.133005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  31.51 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  26.21 
 
 		 389 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  31.94 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 385 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 389 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 407 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  28.69 
 
 		 365 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 391 aa  51.6  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 391 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  26.03 
 
 		 384 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 402 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  27.94 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  29.73 
 
 		 406 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 400 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  27.81 
 
 		 410 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  31.01 
 
 		 387 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 387 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  30.77 
 
 		 380 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.39 
 
 		 393 aa  48.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 391 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  27.08 
 
 		 386 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 387 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 395 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1157  hypothetical protein  33.9 
 
 		 72 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 405 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 380 aa  44.7  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  30.88 
 
 		 354 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  26.98 
 
 		 397 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.8 
 
 		 385 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 378 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 401 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.14 
 
 		 385 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 402 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.14 
 
 		 385 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 397 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.61 
 
 		 379 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  23.08 
 
 		 395 aa  40.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>