129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00432 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  78.54 
 
 		 406 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  100 
 
 		 397 aa  798    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  71.66 
 
 		 410 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  59.09 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  55.16 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  55.53 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  48.21 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  46.85 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  46.25 
 
 		 425 aa  338  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  46 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  46 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  46 
 
 		 425 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  46 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  46 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  46 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  46 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  46 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  44.55 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  44.55 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  44.55 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  44.55 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  44.55 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  46.23 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  44.42 
 
 		 425 aa  325  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  42.79 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  43.9 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  44.97 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  42.61 
 
 		 412 aa  299  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  42.04 
 
 		 414 aa  292  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  42.9 
 
 		 414 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  34.9 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  35.44 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  35.92 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  35.34 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  34.47 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  34.47 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  32.36 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  32.36 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  32.36 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  32.36 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  32.12 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  33.48 
 
 		 458 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  32.35 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  32.69 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  31.86 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  31.86 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  33.17 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  33.58 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  33.99 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  34.8 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  34.8 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  33.99 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  34.8 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  32.23 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  28.74 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  31.56 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.19 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  20.68 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  21.63 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  21.85 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  25 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  22.67 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  21.36 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  20.91 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  20.41 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  20.82 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  23.51 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  22.51 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  23.7 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  23.14 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  20.24 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  20.35 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  24.06 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.96 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>