90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3369 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  85.89 
 
 
418 aa  728    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  86.12 
 
 
418 aa  728    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  85.89 
 
 
418 aa  728    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  85.89 
 
 
418 aa  728    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  89.95 
 
 
418 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  85.65 
 
 
418 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  89.95 
 
 
418 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  85.89 
 
 
418 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  89.95 
 
 
418 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  100 
 
 
418 aa  842    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  90.19 
 
 
418 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  89.71 
 
 
418 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  85.89 
 
 
418 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  85.89 
 
 
418 aa  728    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  85.89 
 
 
418 aa  728    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  55.26 
 
 
418 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  57.42 
 
 
418 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  55.26 
 
 
418 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  57.28 
 
 
419 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 
418 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 
418 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 
418 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 
418 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  56.94 
 
 
418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  57.18 
 
 
418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  56.94 
 
 
418 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  54.23 
 
 
411 aa  443  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  51.92 
 
 
422 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  50.37 
 
 
414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  45.12 
 
 
458 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  33.58 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  33.01 
 
 
400 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  32.35 
 
 
397 aa  229  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  31.88 
 
 
410 aa  226  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  32.55 
 
 
405 aa  223  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  31.65 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  30.81 
 
 
396 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  30.51 
 
 
402 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  32.84 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  30.97 
 
 
438 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  30.97 
 
 
423 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  30.97 
 
 
438 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  30.97 
 
 
423 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  30.97 
 
 
423 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  193  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  33.25 
 
 
421 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  31.75 
 
 
425 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  31.66 
 
 
425 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  31.62 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  32.36 
 
 
414 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  31.08 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  31.62 
 
 
414 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  30.62 
 
 
419 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  27.54 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  24.25 
 
 
459 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  26.74 
 
 
416 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  21.45 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  21.55 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  20.63 
 
 
386 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.29 
 
 
384 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  23.48 
 
 
391 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  23.46 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  23.46 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  21.51 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  23.46 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  23.46 
 
 
389 aa  50.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  22.08 
 
 
387 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  24.1 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  22.63 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  21.28 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  22.22 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  22.22 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  22.35 
 
 
383 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  21.56 
 
 
383 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  22.85 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  20.7 
 
 
365 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  23.16 
 
 
382 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.81 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1158  hypothetical protein  26.19 
 
 
330 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  21.05 
 
 
413 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>