103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2910 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  100 
 
 		 418 aa  846    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  100 
 
 		 418 aa  846    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  68.97 
 
 		 419 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  65.07 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  65.55 
 
 		 418 aa  547  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  65.31 
 
 		 418 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  65.07 
 
 		 418 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  65.07 
 
 		 418 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  65.31 
 
 		 418 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  65.31 
 
 		 418 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  65.07 
 
 		 418 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  54.78 
 
 		 418 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  54.55 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  54.55 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  54.55 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  54.55 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  55.26 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  55.26 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  55.26 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  55.26 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  55.26 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  55.5 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  55.26 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  55.26 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  55.26 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  55.02 
 
 		 418 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  52.22 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  51.57 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  48.16 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  49.27 
 
 		 414 aa  411  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  34.54 
 
 		 406 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  34.13 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  34.47 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  33.91 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  34.46 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  35.58 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  35.26 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  32.27 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  32.75 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  30.84 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 425 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  34.13 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  33.25 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  30.61 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  30.61 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  30.61 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  32.08 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  31.51 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  31.88 
 
 		 419 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  32.28 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  31.35 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  27.62 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  25.27 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  28.77 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  21.18 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  23.86 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  19.84 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  24.06 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  21.15 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  21.18 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.74 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  22.31 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.2 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  21.96 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>