140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0999 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  85.41 
 
 		 425 aa  743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  85.65 
 
 		 425 aa  744    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  100 
 
 		 425 aa  858    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  97.18 
 
 		 425 aa  812    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  85.65 
 
 		 425 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  85.65 
 
 		 425 aa  744    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  85.41 
 
 		 425 aa  743    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  88.08 
 
 		 423 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  85.18 
 
 		 425 aa  740    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  85.65 
 
 		 425 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  85.65 
 
 		 425 aa  744    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  85.65 
 
 		 425 aa  744    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  88.08 
 
 		 423 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  88.08 
 
 		 438 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  88.08 
 
 		 423 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  88.08 
 
 		 438 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  44.44 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  43.42 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  43.14 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  41.75 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  43.38 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  41.87 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  41.3 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  41.38 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  39.11 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  41.08 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  40.45 
 
 		 421 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  38.92 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  40.33 
 
 		 414 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  39.73 
 
 		 419 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  33.49 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  32.41 
 
 		 419 aa  216  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  31.9 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  31.99 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  31.99 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  30.99 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  31.58 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  31.58 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  31.58 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  31.58 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  31.58 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  30.07 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  30.6 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  31.06 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  30.82 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  30.31 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  30.31 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  30.48 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  30.31 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  30.79 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  30.48 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  30.55 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  28.05 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  30.31 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  31.34 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  29.34 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 387 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  26.25 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  20.47 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.18 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  24.25 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.88 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.88 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.26 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.88 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  23.21 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  23.01 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>