192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1417 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  97.42 
 
 		 389 aa  760    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  780    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  99.74 
 
 		 389 aa  777    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  99.23 
 
 		 389 aa  773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  87.89 
 
 		 391 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  91.53 
 
 		 391 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  88.54 
 
 		 391 aa  679    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  88.8 
 
 		 391 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  88.14 
 
 		 391 aa  680    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  74.81 
 
 		 387 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  72.99 
 
 		 389 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  72.77 
 
 		 385 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  68.05 
 
 		 390 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  72.53 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  70.42 
 
 		 402 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  68.41 
 
 		 389 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 385 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  38.12 
 
 		 384 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  38.35 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 378 aa  239  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  40.41 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 390 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  40.79 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  36.97 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  41.18 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  37.36 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  39.21 
 
 		 389 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  37.05 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  34.56 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  38.7 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 385 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  32.43 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  32.55 
 
 		 422 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 396 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.46 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.46 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.2 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.36 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  29.26 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.58 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.94 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.92 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.57 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2283  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.63 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.58 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.58 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.58 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.58 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.01 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.4 
 
 		 379 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.51 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.19 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  25.76 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.23 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.76 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.76 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.07 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.49 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  25.89 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  25.89 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.89 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  28.14 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0045  putative MFS metabolite transporter  27.54 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 395 aa  93.2  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  27.64 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 380 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  26.56 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>