167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3693 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  743    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  97.98 
 
 
397 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  97.78 
 
 
397 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  66.04 
 
 
404 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  34.16 
 
 
395 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
385 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  31.92 
 
 
384 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  33.33 
 
 
381 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  29.38 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  30.96 
 
 
389 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  32.49 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  28.65 
 
 
390 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  26.69 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  30.54 
 
 
382 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  30.79 
 
 
399 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  31.65 
 
 
384 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  30.34 
 
 
390 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  32.96 
 
 
383 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  29.75 
 
 
383 aa  123  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
384 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
385 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
405 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  29.22 
 
 
387 aa  122  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  26.26 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  30.17 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  29.16 
 
 
387 aa  119  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  29.27 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  28.99 
 
 
378 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  29.27 
 
 
389 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  29.25 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  30.64 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  28.73 
 
 
389 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  28.77 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  25.75 
 
 
391 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  31.68 
 
 
389 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  29.09 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  27.49 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  29.39 
 
 
402 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  29.43 
 
 
391 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  29.11 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  26.06 
 
 
365 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  30.25 
 
 
384 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
378 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  28.08 
 
 
391 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  27.7 
 
 
391 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
391 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
392 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  27.7 
 
 
391 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.61 
 
 
422 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  27.7 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  30 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  28.45 
 
 
380 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  27.08 
 
 
384 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  24.56 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  29.97 
 
 
365 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.02 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.02 
 
 
379 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.02 
 
 
379 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.02 
 
 
379 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.02 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  27.96 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.59 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  32.14 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  31.61 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  28.15 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  28.15 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  29.38 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.15 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  30.3 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.2 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  25.36 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.344996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  27.76 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.76 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.76 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.2 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.44 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.22 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  27.78 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  29.97 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.66 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.48 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  26.86 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.37 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  27.78 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  27.09 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.67 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  26.61 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.67 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.04 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>