244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2755 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 392 aa  783    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  60.37 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 385 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  28.35 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  24.47 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1588  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  25.32 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  29.29 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 388 aa  86.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  26.43 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  25.85 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1718  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  23.54 
 
 		 957 aa  83.2  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  24.63 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1592  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  26.46 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1776  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.56574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  26.71 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  30.19 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  24.73 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.41 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.41 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.41 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  29.48 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  27.41 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  25.57 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.14 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.21 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  27.83 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.13 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.63 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.09 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.04 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2283  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.73 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  27.61 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.18 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.18 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.91 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  24.69 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  23.16 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.39 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>