147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5559 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 386 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  57.44 
 
 		 402 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  57.25 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.6 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  34.35 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.16 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.91 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.88 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.5 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.52 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.78 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.51 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.51 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.51 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.06 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.51 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.51 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  38.13 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  31.23 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.23 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.23 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  31.23 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  31.23 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.23 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.23 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.25 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.88 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.84 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.28 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.73 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.11 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  27.76 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0890  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  27.71 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0850  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 401 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0816  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0515849  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  29 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  28.29 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  29.19 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  26.82 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0949  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000750812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  27.17 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  29.97 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  29.38 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  22.4 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  27.12 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  29.59 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  26 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  27.35 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.53 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0757  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  25.45 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  27.73 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0929  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382105  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2283  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>