124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0850 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0890  major facilitator transporter  98 
 
 		 401 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0850  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  755    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0816  major facilitator superfamily MFS_1  88.78 
 
 		 410 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0515849  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  64.19 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  56.3 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4932  major facilitator transporter  57.3 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  33.68 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  28.68 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.15 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.38 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.1 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.1 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.1 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  32.1 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.83 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.91 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.16 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  32.11 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.58 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.42 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.58 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  33.44 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.9 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.27 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.08 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  29.63 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  31.37 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  31.73 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.63 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  29.63 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 380 aa  98.2  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  29.63 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  32.54 
 
 		 386 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  34.98 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.63 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.63 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.63 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.23 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0949  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000750812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.58 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.77 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  26.97 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  29 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  31.04 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  31.11 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  28.46 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.3 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  28.13 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  31.23 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  28.43 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  30.32 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23770  MFS metabolite transporter  29.65 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  31.31 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  27.47 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>