123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2005 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  752    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  34.97 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  29.07 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.05 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.35 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.35 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.09 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.05 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.05 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.05 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.05 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.8 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.97 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.77 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.49 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.34 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.68 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.88 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  29.4 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.4 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  29.4 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  28.42 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.42 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.42 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.03 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  29.26 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  28.27 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  30.94 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  29.89 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  28.84 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  27.85 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  28.77 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.36 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 389 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  29.22 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0757  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  27.89 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  24.71 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0816  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0515849  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  27.58 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0929  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382105  normal  0.442041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.17 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  25.15 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  28.29 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0890  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.142109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2613  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  27.69 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0850  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104948 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  24.93 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  26.82 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  24.22 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0949  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000750812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>