154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3043 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  100 
 
 		 386 aa  756    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1232  putative 3-phenylpropionic acid transporter  94.03 
 
 		 386 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  72.22 
 
 		 385 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  71.96 
 
 		 385 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  75.85 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  72.22 
 
 		 385 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2761  putative 3-phenylpropionic acid transporter  73.28 
 
 		 380 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  69.23 
 
 		 379 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  69.5 
 
 		 379 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  69.5 
 
 		 379 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  69.5 
 
 		 379 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  68.97 
 
 		 379 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.98 
 
 		 379 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  70.67 
 
 		 383 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.37 
 
 		 379 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  67.9 
 
 		 379 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.9 
 
 		 379 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.9 
 
 		 379 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  67.9 
 
 		 379 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.9 
 
 		 379 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.64 
 
 		 379 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  67.9 
 
 		 379 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  67.11 
 
 		 379 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  42.29 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  42.32 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  41.08 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0840  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0402328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  39.56 
 
 		 342 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1284  putative 3-phenylpropionic acid transporter  35.98 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0017  chloramphenicol O-acetyltransferase  32.77 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 397 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  34.12 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 385 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  32.2 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4487  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1634  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273991  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1986  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337503  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1831  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2197  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 406 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  30.9 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1625  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5559  major facilitator superfamily permease  29.4 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.77 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 385 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 386 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  27.99 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 384 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1883  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523287  normal  0.651381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37760  putative MFS transporter  26.2 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112264  normal  0.117862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1450  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  29.57 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  29.19 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3879  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0849528  normal  0.271256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1748  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  30.17 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  30.95 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1439  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0292117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  27.81 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3228  MFS family transporter  25.56 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0436901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  30.17 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2044  transporter, putative  29.2 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0012947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1831  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.641775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  29.06 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1854  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0482615  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1009  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1951  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.577429  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3357  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>